El Hospital Sant Joan de Déu está a la vanguardia en el cuidado del niño y en la salud de la mujer embarazada. Destacan departamentos como el de la Unidad de 3D, que consolida la planificación e impresión 3D con la simulación de cirugías complejas y ofrece servicio a todas las especialidades pediátricas. Gracias a la simulación virtual y la impresión tridimensional, los cirujanos pueden planificar la intervención de una manera muy detallada, y esto les permite estudiar y actuar con precisión, y prever y reducir las posibles complicaciones de la cirugía.
También, cuenta con el Institut de Recerca Sant Joan de Déu (IRSJD), un consorcio liderado por el Hospital Sant Joan de Déu y la participación de grupos de investigación del Institut de Biomedicina (IBUB) y el Institut de Neurociències, ambos de la Universitat de Barcelona, y el Centre de Recerca en Enginyeria Biomèdica (CREB) de la Universitat Politècnica de Catalunya.
